Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TWISTNBQ3B726 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms