Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MICBQ29980 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MICBQ29980 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MICBQ29980 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MICBQ29980 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICBQ29980 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms