Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM187BQ17R55 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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