Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD1Q16881 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD1Q16881 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms