Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms