Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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