Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
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CNGB1Q14028 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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