Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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