Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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