Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MZF1-207ENST00000600004 2683 nt19.48■□□□□ 0.716e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHISA5-218ENST00000497863 972 ntTSL 219.22■□□□□ 0.676e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHARPIN-204ENST00000530216 673 ntTSL 519.02■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-215ENST00000513282 651 ntTSL 317.99■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 GNPTG-203ENST00000527076 2400 ntTSL 217.97■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DMPK-211ENST00000596920 382 ntTSL 317.85■□□□□ 0.456e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CLSTN1-205ENST00000477264 2169 ntTSL 216.14■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-210ENST00000636524 576 ntTSL 416.01■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 515.78■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 315.63■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.086e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHISA5-211ENST00000460758 1297 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.046e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 IFNGR2-204ENST00000421802 727 ntTSL 315.26■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-207ENST00000506879 580 ntTSL 214.81□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-203ENST00000520564 662 ntTSL 214.67□□□□□ -0.066e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-215ENST00000472559 1921 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.156e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ENOPH1-204ENST00000610545 1542 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 213.65□□□□□ -0.226e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SNX15-205ENST00000526702 4713 ntTSL 213.53□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ZSCAN16-AS1-202ENST00000602810 1536 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 212.74□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-208ENST00000474228 876 ntTSL 312.35□□□□□ -0.436e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.466e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.496e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-203ENST00000426832 498 ntTSL 311.86□□□□□ -0.516e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 NUPR1-201ENST00000324873 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.566e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 211.47□□□□□ -0.576e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.636e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.76e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RALA-202ENST00000434466 768 ntTSL 39.84□□□□□ -0.836e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-203ENST00000546588 1059 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.896e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MTF2-209ENST00000487263 863 ntTSL 39.11□□□□□ -0.956e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.136e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.186e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SCML2-204ENST00000491988 807 ntTSL 27.59□□□□□ -1.196e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.226e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.236e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 26.87□□□□□ -1.316e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MTF2-203ENST00000467953 1870 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.316e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MTF2-208ENST00000476037 788 ntTSL 56.7□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SCML2-203ENST00000420857 2435 ntTSL 26.37□□□□□ -1.396e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 26.26□□□□□ -1.416e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.426e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.526e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-204ENST00000427238 467 ntTSL 35.39□□□□□ -1.556e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MTF2-210ENST00000489480 1381 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.616e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DTL-205ENST00000496442 485 ntTSL 24.41□□□□□ -1.76e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-206ENST00000521901 663 ntTSL 23.19□□□□□ -1.96e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.936e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 22.88□□□□□ -1.956e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SLC25A46-207ENST00000513706 6236 ntTSL 21.44□□□□□ -2.186e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.349e-15■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.079e-15■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.783e-10■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.641e-37■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.541e-37■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-37■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-37■■■■■ 28
PABPC4Q13310 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 CLTB-205ENST00000508425 527 ntTSL 320.67■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-40■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.896e-40■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.046e-40■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 TIMM10-203ENST00000525587 486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.662e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 224.85■■□□□ 1.572e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)24.19■■□□□ 1.462e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 28
PABPC4Q13310 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 28
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