Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN2Q12907 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN2Q12907 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN2Q12907 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN2Q12907 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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