Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNMA1Q12791 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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