Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms