Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf57Q0VDD7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf57Q0VDD7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms