Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4CQ08493 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms