Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB2Q08289 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms