Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN1BQ07699 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms