Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNDQ07001 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms