Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms