Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP4Q02446 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP4Q02446 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP4Q02446 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP4Q02446 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP4Q02446 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SP4Q02446 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms