Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms