Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCB2Q00722 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB2Q00722 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms