Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR1P84550 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms