Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms