Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP1P78357 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP1P78357 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms