Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM193AP78312 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms