Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP1P63208 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP1P63208 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms