Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VBP1P61758 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VBP1P61758 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VBP1P61758 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VBP1P61758 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VBP1P61758 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms