Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFC1P60507 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms