Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms