Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN8P56748 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN8P56748 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms