Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAPAP54920 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NAPAP54920 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAPAP54920 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAPAP54920 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAPAP54920 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NAPAP54920 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAPAP54920 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NAPAP54920 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NAPAP54920 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAPAP54920 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAPAP54920 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NAPAP54920 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAPAP54920 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAPAP54920 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAPAP54920 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAPAP54920 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NAPAP54920 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms