Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms