Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms