Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA8P53708 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms