Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRB2P47870 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms