Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN1S1P47710 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms