Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSG1P42857 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSG1P42857 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSG1P42857 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSG1P42857 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSG1P42857 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSG1P42857 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSG1P42857 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSG1P42857 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSG1P42857 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NSG1P42857 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSG1P42857 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NSG1P42857 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms