Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTR1BP42025 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR1BP42025 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms