Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC1P41238 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC1P41238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms