Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms