Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL4P36578 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL4P36578 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL4P36578 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL4P36578 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL4P36578 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL4P36578 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL4P36578 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms