Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX5P35711 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX5P35711 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX5P35711 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX5P35711 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX5P35711 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX5P35711 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX5P35711 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX5P35711 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX5P35711 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms