Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP214P35658 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP214P35658 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP214P35658 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP214P35658 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP214P35658 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP214P35658 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP214P35658 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP214P35658 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP214P35658 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms