Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
OTX2P32243 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX2P32243 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX2P32243 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms