Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR2AP28223 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR2AP28223 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms