Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCSHP23434 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCSHP23434 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCSHP23434 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCSHP23434 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms