Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD247P20963 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD247P20963 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD247P20963 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD247P20963 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD247P20963 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD247P20963 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD247P20963 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD247P20963 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms