Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSP16219 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSP16219 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSP16219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACADSP16219 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms