Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL5P13501 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL5P13501 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL5P13501 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms